library(tidyverse)
library(targets)
library(kableExtra)

1 Leaf disc vs whole-leaf LMA (species-level)

1.1 Pooled

1.2 Seprated

2 SMA table (species-level)

tar_load(sma_tab)
sma_tab |>
  kable() |>
  kable_styling()
Data Slope Intercept R2
All 0.97 [0.94, 1.01] 0.09 [0.02, 0.16] 0.87
Thick~Large 0.93 [0.85, 1.03] 0.19 [0.01, 0.37] 0.86
Thick~Small 1.02 [0.97, 1.07] 0 [-0.11, 0.11] 0.93
Thin~Large 0.91 [0.82, 1.02] 0.2 [0.02, 0.37] 0.71
Thin~Small 0.93 [0.83, 1.03] 0.16 [-0.02, 0.35] 0.84

3 Leaf disc vs whole-leaf LMA (individual-level)

4 Divergence (species-level)

5 LMA and LD (species-level)

6 CV

7 Leaf support cost (species-level)

8 Computing Environment

devtools::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#>  setting  value
#>  version  R version 4.1.2 (2021-11-01)
#>  os       Ubuntu 20.04.3 LTS
#>  system   x86_64, linux-gnu
#>  ui       X11
#>  language (EN)
#>  collate  en_US.UTF-8
#>  ctype    en_US.UTF-8
#>  tz       Etc/UTC
#>  date     2022-04-08
#>  pandoc   2.16.2 @ /usr/bin/ (via rmarkdown)
#> 
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#>  package     * version   date (UTC) lib source
#>  abind         1.4-5     2016-07-21 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  assertthat    0.2.1     2019-03-21 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  backports     1.4.1     2021-12-13 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  base64url     1.4       2018-05-14 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  brio          1.1.3     2021-11-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  broom         0.7.12    2022-01-28 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  cachem        1.0.6     2021-08-19 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  callr         3.7.0     2021-04-20 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  car           3.0-12    2021-11-06 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  carData       3.0-5     2022-01-06 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  cellranger    1.1.0     2016-07-27 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  cli           3.2.0     2022-02-14 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  clustermq     0.8.95.3  2022-01-26 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  codetools     0.2-18    2020-11-04 [2] CRAN (R 4.1.2)
#>  colorspace    2.0-3     2022-02-21 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  crayon        1.5.1     2022-03-26 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  data.table    1.14.2    2021-09-27 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  DBI           1.1.2     2021-12-20 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  dbplyr        2.1.1     2021-04-06 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  desc          1.4.1     2022-03-06 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  devtools      2.4.3     2021-11-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  digest        0.6.29    2021-12-01 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  dplyr       * 1.0.8     2022-02-08 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  ellipsis      0.3.2     2021-04-29 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  evaluate      0.15      2022-02-18 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  extrafont   * 0.17      2014-12-08 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  extrafontdb   1.0       2012-06-11 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  fansi         1.0.3     2022-03-24 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  fastmap       1.1.0     2021-01-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  forcats     * 0.5.1     2021-01-27 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  fs            1.5.2     2021-12-08 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  generics      0.1.2     2022-01-31 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  ggplot2     * 3.3.5     2021-06-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  ggpubr      * 0.4.0.999 2022-04-08 [1] Github (mattocci27/ggpubr@901fdeb)
#>  ggsignif      0.6.3     2021-09-09 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  ggsma       * 0.1.0     2022-04-08 [1] Github (mattocci27/ggsma@2b56c57)
#>  glue          1.6.2     2022-02-24 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  gtable        0.3.0     2019-03-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  haven         2.4.3     2021-08-04 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  highr         0.9       2021-04-16 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  hms           1.1.1     2021-09-26 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  htmltools     0.5.2     2021-08-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  httr          1.4.2     2020-07-20 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  igraph        1.3.0     2022-04-01 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  janitor     * 2.1.0     2021-01-05 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  jquerylib     0.1.4     2021-04-26 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  jsonlite      1.8.0     2022-02-22 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  kableExtra  * 1.3.4     2021-02-20 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  knitr       * 1.38      2022-03-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  lifecycle     1.0.1     2021-09-24 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  lubridate     1.8.0     2021-10-07 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  magrittr      2.0.3     2022-03-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  memoise       2.0.1     2021-11-26 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  modelr        0.1.8     2020-05-19 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  munsell       0.5.0     2018-06-12 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  patchwork   * 1.1.1     2020-12-17 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  pillar        1.7.0     2022-02-01 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  pkgbuild      1.3.1     2021-12-20 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  pkgconfig     2.0.3     2019-09-22 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  pkgload       1.2.4     2021-11-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  prettyunits   1.1.1     2020-01-24 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  processx      3.5.3     2022-03-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  ps            1.6.0     2021-02-28 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  purrr       * 0.3.4     2020-04-17 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  R6            2.5.1     2021-08-19 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  Rcpp          1.0.8.3   2022-03-17 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  readr       * 2.1.2     2022-01-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  readxl        1.3.1     2019-03-13 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  remotes       2.4.2     2021-11-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  reprex        2.0.1     2021-08-05 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rlang         1.0.2     2022-03-04 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rmarkdown     2.11      2021-09-14 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rprojroot     2.0.3     2022-04-02 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rstatix       0.7.0     2021-02-13 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rstudioapi    0.13      2020-11-12 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  Rttf2pt1      1.3.8     2020-01-10 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  rvest         1.0.2     2021-10-16 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  scales        1.1.1     2020-05-11 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  sessioninfo   1.2.2     2021-12-06 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  smatr       * 3.4-8     2018-03-18 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  snakecase     0.11.0    2019-05-25 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  stringi       1.7.6     2021-11-29 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  stringr     * 1.4.0     2019-02-10 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  svglite       2.1.0     2022-02-03 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  systemfonts   1.0.3     2021-10-13 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tarchetypes * 0.5.0     2022-03-16 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  targets     * 0.11.0    2022-03-19 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  testthat      3.1.3     2022-03-29 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tibble      * 3.1.6     2021-11-07 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tidyr       * 1.2.0     2022-02-01 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tidyselect    1.1.2     2022-02-21 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tidyverse   * 1.3.1     2021-04-15 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  tzdb          0.2.0     2021-10-27 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  usethis       2.1.5     2021-12-09 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  utf8          1.2.2     2021-07-24 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  vctrs         0.4.0     2022-03-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  viridisLite   0.4.0     2021-04-13 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  webshot       0.5.2     2019-11-22 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  withr         2.5.0     2022-03-03 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  xfun          0.30      2022-03-02 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  xml2          1.3.3     2021-11-30 [1] RSPM (R 4.1.0)
#>  yaml          2.3.5     2022-02-21 [1] RSPM (R 4.1.0)
#> 
#>  [1] /usr/local/lib/R/site-library
#>  [2] /usr/local/lib/R/library
#> 
#> ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
tar_visnetwork()
#> ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.1 ──
#> ✔ ggplot2 3.3.5     ✔ purrr   0.3.4
#> ✔ tibble  3.1.6     ✔ dplyr   1.0.8
#> ✔ tidyr   1.2.0     ✔ stringr 1.4.0
#> ✔ readr   2.1.2     ✔ forcats 0.5.1
#> ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
#> ✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
#> ✖ dplyr::lag()    masks stats::lag()